Az újgenerációs DNS-szekvenálási technológiák egyre nagyobb számú tumorminta genomszekvenciájának meghatározását tették lehetővé az elmúlt években. Egy frissen publikált brit tanulmány több mint 12 ezer tumorgenom adatait mutatja be, részletesen elemezve a szövetmintákban talált mutációkat. A tanulmányról az ELKH Természettudományi Kutatóközpont (TTK) Enzimológiai Intézetének csoportvezető kutatója, Szüts Dávid írt összefoglaló cikket a Science folyóirat azonos számába, és a Nature kapcsolódó hírében is megszólalt.

A kutatásban szereplő kiemelkedő mintaszám lehetővé tette a daganatokban talált mutációk minden korábbinál pontosabb mintázatokba rendezését. Ezek az úgynevezett mutációs szignatúrák hasznos információt szolgáltatnak az adott tumor kialakulásának okairól, és bizonyos esetekben a kezelés kiválasztásában is segítenek.

A Szüts Dávid által vezetett Genomstabilitás kutatócsoport aktívan kutatja a daganatok mutációs folyamatainak biológiai okait, melynek áttörő eredményeit a közelmúltban számos rangos folyóiratban publikálták.  Feltárták az emlő- és petefészekrákra hajlamosító BRCA génhibák által okozott mutációs folyamatok genetikai mechanizmusát (Chen, 2022), leírták egy eddig kevéssé ismert „kollaterális” mutációs folyamat mechanizmusát (Póti, 2022), és egy amerikai együttműködés keretében pontosan feltérképezték az antivirális védelemben lényeges APOBEC enzimek szerepét a daganatok mutációs folyamataiban (DeWeerd, 2022).

A sejttenyészetes kísérleti minták mutációs mintázatok segítségével történő genomi elemzése lehetővé teszi több egyidejű mutációs folyamat azonosítását

Publikációk:

Chen D, Gervai JZ, Póti Á, Németh E, Szeltner Z, Szikriszt B, Gyüre Z, Zámborszky J, Ceccon M, d’Adda di Fagagna F, Szallasi Z, Richardson AL, Szüts D. (2022). BRCA1 deficiency specific base substitution mutagenesis is dependent on translesion synthesis and regulated by 53BP1. Nat Commun. 13, 226.

Degasperi A, Zou X, Dias Amarante T, Martinez-Martinez A. et al. (2022). Substitution mutational signatures in whole-genome–sequenced cancers in the UK population. Science 376, eabl9283.

DeWeerd RA, Németh E, Póti Á, Petryk N, Chen CL, Hyrien O, Szüts D, Green AM. (2022). Prospectively defined patterns of APOBEC3A mutagenesis are prevalent in human cancers. Cell Rep. 38, 110555.

Póti Á, Szikriszt B, Gervai JZ, Chen D, Szüts D. (2022). Characterisation of the spectrum and genetic dependence of collateral mutations induced by translesion DNA synthesis. PLoS Genet. 18, e1010051.

Szüts, D. (2022). A fresh look at somatic mutations in cancer. Science 376, 351-352.